La mesura de la calprotectina fecal es considera un indicador fiable de la inflamació i nombrosos estudis mostren que, mentre que les concentracions de calprotectina fecal són significativament elevades en pacients amb malaltia inflamatòria intestinal, els pacients que pateixen SII no tenen nivells elevats de calprotectina. Aquests nivells elevats es correlacionen bé amb l'avaluació endoscòpica i histològica de l'activitat de la malaltia.

El Centre de Compres Basades en l'Evidència del NHS ha dut a terme diverses revisions sobre les proves de calprotectina i el seu ús per diferenciar la SII i la MII. Aquests informes conclouen que l'ús d'assajos de calprotectina millora la gestió dels pacients i ofereix un estalvi de costos substancial.

La calprotectina fecal s'utilitza per ajudar a diferenciar entre la síndrome de l'intestí irritable (SII) i la malaltia inflamatòria intestinal (MII). També s'utilitza per avaluar l'eficàcia del tractament i predir el risc de brots en pacients amb MII.

Els nens sovint tenen nivells de calprotectina lleugerament més alts que els adults.

Per tant, és necessari fer la detecció de CAl per a un diagnòstic precoç.